fastp version: | 1.0.0 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
sequencing: | paired end (150 cycles + 150 cycles) |
mean length before filtering: | 150bp, 150bp |
mean length after filtering: | 115bp, 115bp |
duplication rate: | 11.084643% |
Insert size peak: | 43 |
Detected read1 adapter: | CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGAC ->I7_Nextera_Transposase_1 | >Trans2_rc | >I7_Nextera_Transposase_1 | >Trans2_rc |
Detected read2 adapter: | CTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGA ->I5_Nextera_Transposase_1 | >Trans1_rc | >I5_Nextera_Transposase_1 | >Trans1_rc |
total reads: | 140.552136 M |
total bases: | 21.082820 G |
Q20 bases: | 20.007911 G (94.901491%) |
Q30 bases: | 18.984829 G (90.048811%) |
Q40 bases: | 0 (0.000000%) |
GC content: | 50.796292% |
total reads: | 139.565014 M |
total bases: | 16.099619 G |
Q20 bases: | 15.731591 G (97.714059%) |
Q30 bases: | 15.046695 G (93.459950%) |
Q40 bases: | 0 (0.000000%) |
GC content: | 48.694107% |
reads passed filters: | 139.565014 M (99.297683%) |
reads with low quality: | 946.680000 K (0.673544%) |
reads with too many N: | 39.920000 K (0.028402%) |
reads too short: | 522 (0.000371%) |
Adapter or bad ligation of read1
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Adapter or bad ligation of read2
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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